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Projet "1000 génomes bovins"

 Le projet "1000 génomes bovins"

Dans le cadre d’un consortium international, l’INRA et l’UNCEIA ont contribué à une première étape du projet "1000 génomes bovins". L’article publié dans Nature Genetics présente la variabilité mise en évidence et diverses applications dérivées de ces données pour l’identification de mutations responsables d’anomalies génétiques ou impliquées dans le déterminisme de caractères complexes.

Depuis quelques années, la sélection, initialement basée sur l’information phénotypique et généalogique, est devenue génomique. Elle s’appuie de plus en plus sur l’information du génome pour prédire la valeur des reproducteurs et sélectionner ceux dont la descendance sera la mieux adaptée aux systèmes de production futurs. Aujourd’hui permis par une révolution technologique dans ce domaine, le séquençage du génome complet d’un nombre significatif d’individus dans le cadre d’un large consortium international est une voie de choix pour décrire la variabilité de l’ADN à l’échelle de l’espèce.

 Une première étape importante

L’INRA et l’UNCEIA jouent un rôle actif dans un consortium mondial qui vise à séquencer 1000 génomes bovins. La stratégie utilisée a visé le séquençage des ancêtres les plus importants qui ont modelé les races Holstein, Simmental et Jersey, donnant ainsi une image très complète de la variabilité actuelle de ces populations.

L’Inra et l’UNCEIA ont annoncé mardi 15 juillet dans un communiqué le séquençage complet du génome de 234 bovins de races Prim’holstein, Simmental et Jersiaise.

« Cette approche a permis d’identifier rapidement, à titre d’exemple, des mutations modulant les aptitudes à la production laitière ou des anomalies génétiques présentes dans ces races, responsables de mortalité embryonnaire ou à d’une malformation congénitale du squelette, précise l’Inra dans son communiqué. Plus généralement, elle ouvre la voie à la recherche systématique à grande échelle des mutations responsables de la variabilité génétique des caractères observés. »

La publication d’un article dans la revue Nature Genetics est une étape importante de ce projet : “Whole-genome sequencing of 234 bulls facilitates mapping of monogenic and complex traits in cattle”

 Plus d’un millier de séquences de génomes complets d’ici fin 2014

L’objectif de disposer d’au moins un millier de séquences de génomes complets sera atteint dès cette année. Ces données permettent de décrire toute la variabilité existante au niveau du génome de l’espèce. Les applications sont nombreuses, dont la recherche systématique à grande échelle des mutations responsables de la variabilité génétique des caractères. L’identification de ces mutations permettra une sélection plus efficace sur tous les caractères choisis pour un objectif de production durable, indépendamment de leur héritabilité ou de leur facilité de mesure.